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我國科研團隊開發新一代多重熒光原位雜交技術


(資料圖片僅供參考)

2月12日,記者從華中農業大學獲悉,該校曹罡教授、戴金霞副研究員團隊日前在《自然溝通》雜志發表一項研究成果,研究開發了新一代熒光原位雜交方法—p-FISH rainbow,突破現有的技術壁壘,克服目前FISH (fluorescence in situ hybridization,即熒光原位雜交)領域的缺陷和不足,可精準將不同生物(動物、植物和病原微生物等)中多種生物分子(DNA、mRNA 、lncRNA、miRNA、rRNA、蛋白質和小分子等)“一網打盡”。

華中農大供圖

據介紹,近年來單細胞RNA測序促進了細胞異質性的解析,卻伴隨著組織微環境和細胞空間信息的缺失,限制了對生命信息的深度解讀。FISH技術通過特異性雜交解析生物分子的表達水平和空間位置,極大地促進細胞中基因空間表達信息的探究,加速我們對組織微環境和功能機制的深入理解。

目前,FISH技術不斷改進已取得巨大進步,但仍存在一些挑戰,一定程度上限制了對短核酸序的檢測,沒有有效方法同時檢測DNA、RNA和蛋白質。此外,在實現高雜交效率和高信號強度的同時,保證低背景噪音仍然是原位雜交技術的一個關鍵門檻。

針對這些難題,上述研究團隊開發了雜交效率高、信號放大能力強、背景噪音低、特異性好、檢測通量高、應用范圍廣的新型熒光原位雜交方法—π-FISH rainbow。該方法具備高度創新性和優越性,且應用范圍廣泛,可用于動物、植物和微生物(細菌,病毒和寄生蟲等)樣品的檢測,不拘泥于樣本制備限制,也適用于冰凍樣本、石蠟樣本和整體胚胎樣本的檢測。

同時,該研究利用π-FISH rainbow方法探究了重要的生物學問題,并取得新發現,成功鑒定前列腺癌患者循環腫瘤細胞中雄激素治療抵抗標志物雄激素受體剪接變體7 (ARV7),解決了前列腺癌治療中缺乏精準診斷的難題,為前列腺癌患者雄激素耐藥性治療提供重要臨床指導。

π-FISH rainbow具備高靈敏度,該研究首次發現腫瘤細胞周期關鍵調控因子lncRNA?MALAT1具有三種不同的亞細胞定位模式。其中,MALAT1的核聚集模式顯示與miR145-5p的高度共定位。這些研究展現出π-FISH?rainbow技術在基礎科學研究和臨床診斷中的巨大應用潛力,為生命科學研究和臨床診斷提供有力工具。

據悉,曹罡教授和戴金霞副研究員為該論文共同通訊作者,博士研究生陶影峰和周小六為共同第一作者。該研究得到國家自然科學基金、廣東省重點研發計劃、中央高校基本科研業務費專項資金項目資助。

關鍵詞: 熒光原位雜交 前列腺癌 臨床診斷 副研究員 生物分子

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