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【速看料】國際首個(gè)雙生病毒-植物-昆蟲數(shù)據(jù)庫構(gòu)建成功


(資料圖片)

日前,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所作物病原生物功能基因組研究創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)聯(lián)合國內(nèi)其他科研單位,構(gòu)建了國際首個(gè)雙生病毒-植物-昆蟲數(shù)據(jù)庫。該數(shù)據(jù)庫提供了最完整的雙生病毒、寄主植物、傳毒介體,病毒-植物-昆蟲互作信息,并提供多種在線工具,可實(shí)現(xiàn)相關(guān)文獻(xiàn)同步更新。相關(guān)研究成果在線發(fā)表于《分子植物(Molecular Plant)》。

國際首次建立雙生病毒-植物-昆蟲數(shù)據(jù)庫 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所供圖

雙生病毒是全球范圍內(nèi)危害植物最嚴(yán)重的病原物之一,有520多種,可通過煙粉虱、葉蟬和蚜蟲等傳播,侵染棉花、番茄及瓜果等多種重要經(jīng)濟(jì)作物,造成嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失。

這個(gè)數(shù)據(jù)庫主要包括雙生病毒相關(guān)信息的瀏覽、可視化、進(jìn)化分析、工具欄、文獻(xiàn)五大模塊,可完成病毒、寄主信息的完整搜索與下載,為雙生病毒的后續(xù)研究奠定了重要基礎(chǔ)。數(shù)據(jù)庫利用網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)將病毒-植物-昆蟲的互作關(guān)系進(jìn)行可視化,通過雙生病毒全基因組序列比對,構(gòu)建了目前最為全面的雙生病毒科的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系;同時(shí)該數(shù)據(jù)庫提供比對功能,可對病毒基因、蛋白進(jìn)行比對與搜索,并及時(shí)更新雙生病毒相關(guān)的研究進(jìn)展及重要國際雙生病毒研究人員。

該研究得到國家自然科學(xué)基金及國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃等項(xiàng)目的資助。

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