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每日焦點!我國科研團隊構建全球首個牧草圖形泛基因組


(相關資料圖)

3月14日筆者從四川農業大學獲悉,該校黃琳凱教授團隊構建了首個美洲狼尾草圖形泛基因組,并揭示了狼尾草耐熱的分子機制,相關研究成果發表在《自然遺傳學》上。

美洲狼尾草,又名珍珠粟,全球種植面積約3100萬公頃。在我國,它是一種重要飼草。在研究過程中,黃琳凱團隊聯合國內外多家單位,從全球8個地區收集的394份美洲狼尾草核心種質中選取了10份代表性材料,將基因組從頭組裝,獲得了高質量的基因組組裝序列,并結合已報道的基因組構建了首個美洲狼尾草圖形泛基因組,共發掘424085個結構變異。

同時,基于對泛基因組圖譜進行全基因組關聯分析,團隊還發現了143個重要農藝性狀相關聯的變異位點,并挖掘到與產量性狀相關的候選基因446個。黃琳凱表示,與參考基因組相比,圖形泛基因組包含的遺傳信息更全面,通過發掘其中的結構變異,能夠更好地解析植物表型和農藝性狀的不同,為下一步育種奠定重要的研究基礎。“該項研究可加速攻關牧草業各環節‘卡脖子’技術,培育突破性牧草優良品種,助力提升優質安全食物的供給保障能力,為國家糧食安全貢獻草業科研的力量。”她說。

美洲狼尾草高質量基因組組裝和泛基因組分析。受訪者供圖

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